药物在发挥治疗作用的同时，一般都会同时出现一些不良反应，不良反应的发生通常与药物剂量相关，并且与患者个人体质有关。不同种类的抗精神病药物，其不良反应也不相同，抗精神病药一般作用于脑内受体或递质，常出现神经系统不良反应。

锥体外系不良反应是*常见的精神病药物不良反应，也是所有抗精神药物的共同不良反应。由于抗精神病药物阻滞了多巴胺受体，同时影响了锥体外系统的递质传递，而出现锥体外系症状，如运动不能、意向性震颤或静止性震颤、肌肉强直，急性肌张力异常，静坐不能，迟发性运动异常等。恶性综合征是精神病药物*严重的不良反应，氯丙嗪被首先发现可导致恶性综合征，典型症状是高热、肌强直和不同程度的意识障碍。

有些抗精神病药物具有较强的镇静、催眠的作用，特别在刚开始用药的一段时间，症状会比较明显，经过数周可逐渐适应。精神药物可以引起皮疹、癫痫、心血管系统症状，肝功能异常、粒细胞减少、食欲增加等不良反应。