1、血象检查
血细胞计数显示中性粒细胞减少，血小板减少。
2、血生化检查
可有轻重不等的高结合胆红素血症(34.2～256.5μmol/L)，血清碱性磷酸酶，γ-谷氨酸转酞酶及胆固醇显著升高，转氨酶可有增加，其他肝脏蛋白通常正常，可有轻度溶血，凝血时间延长，轻度酸中毒和提示先天性感染的脐血IgM增高，肝内胆管发育不良血中胆酸，胆固醇明显增高，后者可高达14.3～26.0mmol/L(550～1000mg/dl)，谷丙转氨酶(ALT)轻度升高，碱性磷酸酶增高十分显著。
动态观察血胆红素对鉴别也有一定帮助，如逐渐下降，应考虑为肝炎，婴儿肝炎时血甲胎蛋白明显增高，而胆道闭锁时血碱性磷酸酶，5-核苷酸酶及低密度脂蛋白(lipoproteinX，LP-X)增高显著，但两者有少数重叠。
3、新生儿乙型肝炎病毒感染
除血液外乙型肝炎病毒可存在于大多数体液，包括乳汁，但粪便中似乎没有。
4、病原学检查
鼻咽部冲洗物，尿，大便和脑脊液可用于培养病毒，特殊的血清学检查可有助于诊断(TORCH效价)。
5、α1-抗胰蛋白酶(α1-AT)缺乏
实验室检查血清蛋白电泳α1球蛋白明显降低，胰蛋白酶抑制容量减少，免疫扩散法测定血清α1-AT浓度比正常减少50％以上，肝病理切片肝细胞内有耐淀粉酶的PAS染色阳性小体，但最可靠还是Pi基因型测定。
6、肝组织学检查
经皮肝穿刺所得的肝组织学检查可区分肝内或肝外胆汁淤积，但不能区分肝组织内的特殊感染原，例外的是巨细胞病毒可在肝细胞胆管上皮细胞胞浆内形成包涵体，以及疱疹病毒的核内嗜酸性包涵体，常见表现为小叶结构紊乱的局灶性坏死，多核巨细胞形成，肝细胞空泡样变，索样结构消失，肝细胞内和小管性胆汁淤积可以是持续性的，门脉改变不明显，但可出现新生结节增生和轻微纤维样变。
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