巧克力囊肿一般不会癌变，但有癌变的风险，建议患者及时就医。

巧克力囊肿是一种良性卵巢病变，通常由子宫内膜异位症引起，是指其子宫内膜组织生长在子宫外的其他部位，如卵巢、输卵管等。这些异位内膜组织在月经周期也会受到激素的影响，导致出血和炎症反应，最终形成巧克力囊肿。巧克力囊肿本身通常不会癌变，但它可能与卵巢癌有关。

巧克力囊肿可能会引起盆腔疼痛、月经不规律、不孕、生育能力等症状。此外，巧克力囊肿与卵巢癌有一定的关系。研究表明，患有巧克力囊肿的女性患卵巢癌的风险相对较高。然而，这并不意味着所有的巧克力囊肿都会癌变，而且大多数巧克力囊肿仍然是良性的。

巧克力囊肿患者建议定期随访和检查，必要时可在医生指导下进行手术切除和病理检查，以消除卵巢癌的可能性。