随着时间的推移，崔月犁同志对中医西化越来越忧心忡忡。他在《主持卫生工作》中指出：“有些人在指导思想上不明确，不是在发展中医和发展西医过程中进行中西医合作，而是直接以西医代替中医。嘴上承认中医是科学的，实际心里认为中医是落后的，不知不觉地把中医消灭了。”1997年他看了《中医药走向世界的若干理论问题》一文后打电话给我，很激动地说道：“不少中医专家对我说，你是第一位从中医核心概念的定义入手，来研究中医基础理论问题的人。大家认为你所作的定义是准确的、科学的。比如你在文中的三个小标题（指‘接轨乎，无轨可接’；‘改轨也，自毁其轨’；‘铺轨者，任重道远’）既形象又准确。中医学的轨，就是以中国传统文化为根而形成的中医基础理论与辨证论治。这是中医的灵魂和生命线，是中医特色和优势所在。为什么要找到国外，和人家的西医接轨呢？这不是打着接轨的旗号搞西化吗？这是将中医毁于萧墙之内的历史大错呀！”过了一会儿他又打电话给我，拿起听筒时他只说了一句话：“我要是再年轻十岁就好了。”良久，才听到他轻轻放下电话的声音。我懂得他的心，如果他尚在管理岗位，他是不会放任“改轨也，自毁其轨”的问题继续蔓延的。1997年他在《中医沉思录》中进一步明确指出：“中医应该走自身发展的道路，中医机构应该突出中医特色。如果形形色色削弱中医的做法不改变，或在漂亮的口号下使中医很快地西化，那就重复了日本明治维新以后消灭中医的悲剧”。这些警世之言，值得每一个有传统文化责任心的中国人而不仅是中医人时刻铭记在心。
崔月犁同志生前常说，教育是发展中医的关键。他最诙谐的说法是，不要“挂着梅兰芳的牌子，唱着朱逢博的调子”。1982年4月的“衡阳会议”上，他在谈到中医教育的任务时指出：“中医要振兴，要发展，关键是人才。要解决中医后继乏人、后继乏术，就一定要把中医教育搞好，培养有过硬本颇的中医。不要弄成中不中、西不西，两个半瓶子醋。”谈到中医教育目标时，他说：“中医学院的培养目标，是培养合格的中医师。”谈到中西课程安排的原则时，他强调：“应当按照中医的理论体系从事教学，要在系统掌握好中医理论的基础上，适当学一些西医知识。”后来他在《中医沉思录》中，专门讨论了“中医师带徒是解决中医队伍后继乏人的重要途径”。1990年举办首届“全国老中医药专家学术经验继承工作”时，他特地打电话建议我主管的《中国医药学报》配合这一工作，搞几年“有奖征文活动”来促进学术继承人作好学术总结，提升继承工作的效果。
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