呼吸肌疲劳或功能衰竭如果在呼衰的发生中起重要作用，则应首先纠正和去除引起呼吸肌功能障碍的诱因。总的原则有：保证呼吸肌足够的能量供应，包括补充营养、纠正电解质异常特别是磷和镁的异常、纠正低氧血症和高碳酸血症、改善心输出量等；针对呼吸肌疲劳进行特异性治疗，包括补充营养、呼吸肌功能锻炼、呼吸肌休息等。其具体预防措施如下所述。
一、补充营养
研究表明，多数慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者存在营养代谢障碍，主要表现为患者处于高代谢状态，能量需求大于能量供给。多种因素可影响患者的能量供应，如食欲不振、胃肠营养物的不良作用、进食时低氧血症、进食高碳水化合物时CO2产量增多超出通气能力等。动物实验及人体研究都已证实，营养不良可使Ⅱ型肌肉纤维萎缩，导致肌肉无力。当患者的实际体重低于平均标准体重的71％时，最大经口吸气压、肺活量和最大自主通气量均明显低于正常人。补充营养可增加吸气压力和体重，在撤机过程中适当补充营养，给足热量可增强呼吸肌功能，提高撤机的成功率。关于补充营养对肌肉疲劳的疗效还存在一定的争议，造成结论不同的原因与患者营养不良的程度、营养补充的方式和时间等多因素有关。此外，补充营养能否对COPD患者的预后产生影响亦需进一步证实。
二、功能锻炼
对呼吸肌功能进行针对性锻炼不但能改善呼吸肌功能，还能增加整体运动能力。通常认为，呼吸锻炼仅适用于中度通气功能损害伴有气促的患者，对重度通气功能损害者不宜应用呼吸锻炼。呼吸锻炼应遵循3个基本原则：负荷性、针对性和可逆性。锻炼应循序渐进，不可急于求成，应在一定的强度负荷下针对某一特定功能长期锻炼。主要目标是增加呼吸肌的力量和耐力以及增强抗疲劳能力，过度锻炼有可能加重呼吸肌疲劳和导致肌肉损伤。