先兆流产的概率很高，自然流产或胚胎停产的概率最终达到总妊娠的15%左右。因此，只有明确先兆流产的病因，才能采取更有效的措施来保护胎儿。

一般来说，先兆流产的主要因素包括胚胎本身、母亲的因素，或免疫功能异常的存在，或环境因素的存在。

目前的研究发现，超过一半的流产与胚胎本身的染色体异常有关，包括染色体数量异常和结构异常。因此，如果流产后胚胎染色体检查，可能存在三体异常、单体异常甚至四倍体、染色体易位、嵌合体或染色体缺失等问题。这可以用大自然的适者生存来解释，这样的胚胎保护基本上没有意义。

还有一些流产与孕妇自身的身体因素有关。例如，孕妇患有全身性疾病，因为严重感染或高烧或贫血，或巨细胞病毒，导致胚胎发育不良或胎盘循环不良，影响胚胎发育，最终导致流产。有的女性有子宫纵隔、粘膜下子宫肌瘤、宫腔粘连、宫颈内口松弛等问题，导致流产。一些妇女在怀孕早期过度服用禁忌药物，或继续吸烟和饮酒，或黄体功能不全、甲状腺功能异常或严重糖尿病，可影响胚胎发育，最终导致流产的可能性。

相对而言，免疫功能异常导致流产的概率略小，但一些孕妇在怀孕期间对胎儿的免疫耐受性降低，可导致流产，如母胎血型抗原不合或封闭抗体不足。

孕妇在怀孕期间过多接触有害有毒物质，如前甲醛、苯或过度放射线，也有可能导致流产。