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毛囊炎与疱疹的区别如下：1、病因不同：毛囊炎是由免疫力下降和细菌感染引起的，多为痤疮丙酸杆菌感染。疱疹是由于免疫力下降和病毒感染引起的。病毒多为单纯疱疹病毒或水痘带状疱疹病毒。2、临床治疗不同：抗菌消炎药物可用于毛囊炎的治疗，如克林霉素磷酸酯凝胶、复方多粘菌素B软膏、夫西地酸软膏、氧氟沙星凝胶等。口服药物可选择多西环素胶囊或幸福霉素胶囊。疱疹的治疗需要外用阿昔洛韦软膏。如果疼痛严重，也可以用辣椒碱软膏，服用盐酸伐昔洛韦片或泛昔洛韦片。