在回答这个问题之前，先来了解一下月经期的生理变化。月经期通常持续3-7天，其中第一天通常是出血较多的日子，也是最容易引起不适的时候。月经期过后的几天，由于子宫内膜已经剥离完毕，再加上卵巢开始排卵，子宫内膜也开始进行重建，此时女性身体的内分泌水平开始逐渐回复正常。

即便是在月经过后的几天，女性身体仍然需要时间恢复，以及彻底清除产生的废物和血块。即使月经结束，子宫颈仍然处于敏感状态，容易引发感染。因此，虽然月经干净两天了，但不建议在这段时间进行性行为。

二、月经期后两天同房可能存在的风险

1. 感染：在月经期结束后的两天内，女性的生殖道仍然比较敏感，容易受到细菌和其他病原体的侵袭。而如果进行性行为，可能会增加感染的风险，诱发妇科炎症等问题。

2. 计划怀孕：如果还没有计划怀孕，那么在月经干净两天的时间内进行性行为是不安全的。虽然排卵一般发生在月经结束后的约14天内，但有些女性排卵期不规律，此时可能仍然有怀孕的风险。

3. 性爱体验：月经过后的两天，女性身体仍然在恢复期，可能会感到疲倦和不适。此时进行性行为可能会增加不适感，并影响性爱的体验。所以，尊重女性的身体感受是非常重要的。

三、安全性行为建议

根据上述解答，我们可以得出的是，月经干净两天了并不代表就可以进行性行为。为了保护女性的身体健康，下面给出一些建议：

1. 了解自己的身体：女性应该了解自己的月经周期和身体变化，根据个人情况规划性行为的时间。

2. 使用安全措施：如果有必要在月经结束后的两天内进行性行为，务必使用安全措施，如避孕套，以保护女性免受感染和不期望的怀孕。

3. 尊重身体感受：如果女性感到身体疲倦和不适，不要勉强进行性行为，尊重自己的身体感受。

4. 寻求医生建议：如果有任何疑虑或不适，建议咨询妇科医生，获得专业的建议和指导。

在月经结束后的两天内进行性行为仍然存在一定的风险。为了保护女性的身体健康，建议在这个时间段内避免性行为或采取适当的安全措施。在性行为方面，建议尊重并照顾女性的身体感受，确保双方都处于舒适和安全的状态下。以上建议不仅适用于月经干净两天的情况，也适用于其他时段。最重要的是，保持良好的沟通和理解，共同维护身体健康和性生活的和谐。