《药性趋向分类论》是尚志钧提出的一种新的药性分类。据药物作用趋势而分行、守两大类。行类含上行、下行、通行、化行。上行以升散为主，如升举下陷，发散外邪；下行以降下为主，如平喘咳，泻下利水；通行以通畅为主，如气血不通作痛，用通行药使气血通即可止痛；化行以转化为主，如食积、痰饮通过转化，成为无害物。守即固守，不固守即出现虚损，凡虚损宜补。守类含补益和收敛两类。各类再分若干小类，每小类先述概要，举药名，次述共同作用、用途，再次述各药其他作用。药为什么能治病，因为药有很多特性，这些特性或能祛除病邪，或能消除病因，或能补虚扶弱，或能调整脏腑气机功能，消除人体阴阳偏盛偏衰偏亢的病理状态，以期恢复人之正常状态。
尚志钧积50多年研究本草之经验，使药物分类更科学，药性更清晰，并对300多味常用中药药性作用直说引述，正说反证，浅说深论。
此外，尚志钧所著《脏腑病因条辨》以中医五脏、六腑和病因（风、寒、暑、湿、燥、火、气、血、痰、饮）为单元，对临床症状进行归类，颇为精细。
阐发本草新见解
尚志钧集毕生精力和情感于本草文献，在古本草史料的世界寻寻觅觅，一以贯之地刻苦钻研，因执着的努力而终于成为本草文献的知音。无论以哪一药物条文，或哪一部本草专著，或哪一位本草人物为前提，互相联系都是双向的，而更重要的则是沉浸其间的推敲，确实有其独特的发现和创获，局外人就无法体悟了。《本草人生》中的“论文题录”计268篇，内容广博而深入，不仅有对古本草史料的广搜精求，对纸上遗文的爬梳考订和辨证精释，亦有对新近发掘的地下实物如马王堆五十二病方、敦煌出土残卷等的整理和运用。在268篇学术论文中，关于李时珍和《本草纲目》的论文有19篇。在学术思想方法论方面，曰《本草文献研究的意义及作用》，曰《本草文献研究的目的》，曰《本草文献研究思路》，等等，是“熔铸古今，学以致用”的实践，亦相当引人入胜。其实质则在于一方面自觉脱除旧染与时弊，融目录、版本、校勘、考据、章句、修辞之法于本草学之中，另一方面则弘扬中国学术传统中的优秀方法，并赋予它们以时代精神，超胜前人，彰显出尚公的本草学思想和风格，亦显见其著述之功力。
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