3.小肠黏膜活检可通过内镜或经口插入Crosby肠活检导管，负压切取薄层肠黏膜，分别进行组织学检查及直接测定各种双糖酶含量尤其有利于先天性糖吸收不良的诊断。
4.右旋木糖吸收试验：在肾功能正常健康搜索的情况下测定尿内木糖的排出量，可反映小肠的吸收功能该试验对诊断小肠黏膜普遍性损害所致吸收不良的阳性率达70％以上；对胰腺疾病和仅累及回肠的疾病，木糖试验阳性；肾功能不全者或胃排空延迟者，可出现假阳性。方法：空腹服右旋木糖5g（溶于250ml水中）再饮水200～300ml，收集5h的尿，测定尿内木糖含量。正常值（1.51±0.21）g如排出量为1～1.16g为可疑，＜1g为异常。婴幼儿不易采集尿液可测定1h后血中木糖含量，如＜200mg/L视为吸收不良。
5.维生素B12吸收试验或Schilling试验：先肌内注射维生素B121mg，使体内库存饱和，然后口服60Co（钴）或57Co标记的维生素B122μg，收集24h尿液，测定尿内放射性含量。正常人经尿排出量应大于口服量的8％～10％。低于此值为吸收不良，常见于回肠末端吸收不良或被切除后肠内细菌过度繁殖（如盲襻综合征）及内因子缺乏所致恶性贫血等。
6.14C-甘氨胆酸呼气试验：口服14C-甘氨胆酸370MBq（10mCi），正常人绝大部分在回肠吸收，循环至肝脏再经胆管进入小肠仅极少部分能进入结肠而从粪便排出另一部分则在体内代谢成14CO2通过肺呼出。正常人口服14C-甘氨胆酸后4h内14C02的排出量低于总量的1％，24h粪内排出小于8％。小肠细菌过度繁殖回肠末段病变或外科切除者呼气中14CO2和粪内14CO2的排出量增高。
7.肠液检查插管至十二指肠或空肠抽取肠液，做镜检或细菌培养；测定肠液中胰酶的活力以评价胰腺功能等。
8.汗氯测定：汗氯＞60mmol/L有助于胰腺囊性纤维性变的诊断。
9.其他如糖耐量试验：口服2g/kg受试糖后健康搜索，如糖耐量曲线低平，提示存在吸收不良，但血糖可受多种因素影响，结果需结合临床才有意义。用层析法可测定粪糖，并区别各种不同种类的糖，也有采用醋酸铅法测定粪便中乳糖，这些方法对诊断均有参考意义。
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