肾静脉血栓在新生儿期的临床表现缺乏特异性，常被原发疾病掩盖。典型的肾静脉血栓有腹痛、血尿和肾肿大三大主症，但腹痛在新生儿期很难发现，代之以血小板减少。新生儿肾静脉血栓的症状主要有以下几种：
1、脱水
脱水包括隐匿性失水的病史、症状及体征。
2、突发血尿和少尿
突然出现与原发病无直接相关的血尿、少尿或无尿、血小板减少及高血压。60％的患儿有24小时的肉眼血尿，继之为持久性镜下血尿。36％患儿有少尿或无尿，蛋白尿及酸中毒亦较常见。患儿血压在突然下降后急剧上升。高血压可持续几天、几个月或更长时间。可伴有恶心、呕吐和腹胀、发热、黄疸、全身水肿。肺及肢体栓塞、精索静脉或胃食管静脉曲张等现象亦可能见到。
3、肾脏肿大
50％～60％的患儿可触及肿大的肾脏。肾脏的大小、厚度及紧张度均有异于生理情况下的肾脏。因肾包膜囊内张力增高使肾脏硬度增加，触诊时患者有不适的规避反应。右侧病变较左侧多见，若两侧均受累则彼此的大小程度有差异。