严重急性呼吸综合征的临床表现为潜伏期1～16天，常见为3～5天，起病急，以发热为首发症状，可有畏寒，体温常超过38℃，呈不规则热或弛张热、稽留热等，热程多为1～2周，伴有头痛、肌肉酸痛、全身乏力和腹泻，常无鼻塞、流涕等上呼吸道其他症状。起病3～7天后出现干咳、少痰、偶有血丝痰，肺部体征不明显，部分患者可闻少许湿啰音；病情于10～14天达到高峰，发热、乏力等感染中毒症状加重，并出现频繁咳嗽、气促和呼吸困难，略有活动则气喘、心悸，被迫卧床休息，这个时期易发生呼吸道的继发感染；病程进入2～3周后，发热渐退，其他症状与体征减轻乃至消失，肺部炎症改变的吸收和恢复则较为缓慢，体温正常后仍需2周左右才能完全吸收恢复正常。轻型患者临床症状轻，病程短，重症患者病情重，进展快，易出现呼吸窘迫综合征。儿童患者的病情似较成人轻，有少数患者不以发热为首发症状，尤其是有近期手术史或有基础疾病的患者。
