1、急性胃肠炎：潜伏期约1～2天，症状多较轻，低热或不发热，腹泻呈水样稀便，有腹痛而无里急后重，个别患者腹泻严重类似霍乱，2岁以下儿童可表现为痢疾样症状，大部分病例经2～5天自愈，重症可持续1～2周。
2、外伤感染：因皮肤伤口接触河水，污泥而感染，轻者仅有局部溃疡，重者可发生蜂窝织炎。
3、败血症：患者有严重慢性疾病时，本菌可由伤口或肠道侵入血流，嗜水气单胞菌感染败血症可并发感染性心内膜炎，坏死性肌炎，内眼病变和迁徙性脓肿等。
4、其他感染：本菌偶可引起术后感染，尿路感染，褥疮感染，胆囊炎，腹膜炎，肺炎，脑膜炎，坏死性肌炎和骨髓炎等。