1. 南京鼓楼医院：南京鼓楼医院是江苏省内知名的三甲医院，男科科室拥有先进的诊疗设备和专业的医生团队。其男科科室是全国西医三甲医院中最早有独立建制的男科之一，现已成为集男科医疗、教学、科研为一体的专业、正规的男科疾病医学中心。

2. 南京市第一医院：南京市第一医院是南京市卫生局直属的三级甲等综合性医院，男科科室技术力量雄厚，诊疗效果显著。科室技术力量雄厚，可开展多种特色技术，如前列腺绿激光汽化切除、前列腺电切术等。

3. 南京同仁医院：南京同仁医院是一家集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，男科科室拥有先进的诊疗设备和专业的医生团队。同仁医院男科治疗技术先进，提供多种男科疾病的诊疗服务。

4. 南京医科大学附属第一医院：南京医科大学附属第一医院是一所具有百年历史的三甲医院，男科专业实力雄厚。其泌尿外科是国家临床重点专科建设单位，卫生部首批人类精子库技术准入单位学科，是国内一流的现代化学科。

南京的多家三甲医院均设有专业的男科科室，拥有丰富的男科疾病治疗经验和先进的医疗设备。患者可以根据自己的实际情况和需求，选择合适的医院进行治疗