部分患者无自觉症状，有症状者多表现为周期性发作。

1、痛经：以继发性、渐进性痛经为特点，疼痛部位多位于下腹部及腰骶部，可放射至阴道、会阴、肛门、大腿部。多开始于经前1～2天，月经干净后疼痛缓解并逐渐消失。

2、月经不调：有时周期缩短、经量增多或经期延长，亦有经前点滴出血者。

3、不孕：内膜异位患者不孕率较正常妇女高得多。

4、其它：部分病人有性交疼痛或不适，如果病灶侵入了直肠、阴道或骶骨部位，在经前或经期中，会发生便秘或排便时疼痛。

腹壁疤痕及脐部的子宫内膜异位症则出现周期性局部肿块及疼痛。

内在型子宫内膜异位症患者往往子宫胀大，但很少超过3个月妊娠。如为后位子宫，往往粘连固定。