根据一般的健康证书处理要求，如果患有妇科疾病，可能会对健康证书的处理有一定的限制。

能否办理健康证，取决于妇科疾病的种类和严重程度。一些较轻的妇科疾病，如月经不调、阴道炎等，通常对健康证的办理影响不大。这些疾病一般可以通过适当的治疗和调理来控制，不会对健康产生明显的影响。然而，对于一些严重的妇科疾病，如宫颈癌、卵巢癌等，可能会限制健康证明的处理。这些疾病需要更详细的检查和治疗，可能需要提供相关的医疗证明或延迟健康证明。这是因为这些疾病可能会对健康产生更大的影响，需要更仔细的观察和治疗。

建议患者在申请健康证明前咨询医生或相关机构，了解具体要求和限制。医生可以根据患者的病情和健康证明的要求给予相应的建议和指导。在一些严重的妇科疾病中，可能需要更详细的检查和治疗，以确保患者的健康和安全。