1. 南京医科大学第一附属医院：该院的神经内科是国家卫健委临床医师培训基地，江苏省临床重点专科，并设有“癫痫中心”。科室设备先进，功能齐全，医疗技术雄厚，为癫痫患者提供高效、精准的诊断和治疗。

2. 南京鼓楼医院：神经内科为国家临床重点专科，江苏省临床重点专科，设有癫痫与发作性疾病亚专业，拥有最新的癫痫诊疗设备和诊断治疗技术，对难治性癫痫的治愈率较高。

3. 东南大学附属中大医院：神经内科是江苏省神经病学研究中心（共建单位），江苏省医学重点学科，拥有先进的诊治设备和全面的神经系统危急重症救治技术，对癫痫等疾病的诊治具有丰富经验。

4. 东部战区总医院：神经内科率先创建了国内首个网络化、区域性的南京卒中注册系统，为神经肌肉疾病、神经变性疾病、脑神经损伤、癫痫的诊断提供了重要的科学依据和良好的治疗指导。

5. 南京市第一医院：神经内科为南京医科大学硕士学位授予学科，博士学位授予点，是“江苏省脑血管病介入诊疗培训基地”，在癫痫等疾病的诊疗方面也具有丰富的经验。

6. 南京癫痫病医院：这是一家集临床、教学、科研、预防、保健、康复为一体的专家型中医医院，设有癫痫专科，擅长治疗癫痫等神经内科疑难疾病，医生团队经验丰富，治疗效果显著。

南京的癫痫病患者可以根据自己的实际情况和需求，选择以上推荐的医院进行治疗。这些医院在癫痫病的诊断和治疗方面具有较高的专业水平和丰富的临床经验，能够为患者提供全方位、个性化的医疗服务。