肠瘘患者的饮食是一个很重要的方面，很多食物对于结肠瘘患者的康复很不利，因此在平日摄取时应多加留意，免得一旦失去了平衡，造成健康上的负面作用。饮食上应食含有丰富蛋白质类等食品，如瘦肉、牛肉、蘑菇、大枣、芝麻。另外，还有木耳、山药、香菜、韭菜、茄子、芡实、菱、藕、茴香、荔枝、鸡、羊肉、无花果等。
不宜食用的食物主要有：
白糖：有利于细菌在肠道内迅速繁殖，特别是大肠杆菌，它易于形成草酸，是风湿病的诱因。
肉类：没有富含纤维的纤维。如果没有充分咀嚼，肉类就不易消化，导致肠内细菌繁殖。
精制面粉：容易使大便变硬，特别是在食物结构中缺乏水果和蔬菜时，食用者的情况会变得更加严重。
饱和脂肪：饱和脂肪是指动物脂肪和人造脂肪奶油。饱和脂肪的聚集改变了肠道内的菌群状况，增加了那些促使胆汁酸盐变为致癌物质的细菌含量。
谷蛋白：谷蛋白会形成一种糊状的黏性物质，附着在肠道内壁上。它延缓了食物的通过，容易引发肠道腐败，而且妨碍了维生素B族的吸收。