长期吸烟会导致体内慢性缺氧，造成器官损害，促进动脉粥样硬化和血压升高，从而导致脑梗塞甚至中风。

尼古丁通过气管通过气管进入肺部，通过肺泡上皮细胞进入血液，并进入大脑8秒。Nicholas Ding Ke促使神经末梢释放肾上腺素和去甲肾上腺素，导致血压升高，心跳加快，血液减少到其他组织。尼古丁还促进血小板粘附和聚集，形成血栓，干扰脂质代谢，导致动脉硬化和空腔狭窄。

香烟焦油含有多种致癌和促癌物质。它可以沿着烟流进入吸烟者的呼吸道，附着于咽部、喉部、气管和支气管粘膜表面，其中大约90%进入气溶胶形式的肺部，导致支气管炎、哮喘和慢性阻塞性肺病。烟焦油进入肺部是不容易的，因为它的脂溶性和粘附性，以及致癌物和促进肺癌的物质可以使肺组织细胞受损和癌变。

苯并芘进入呼吸道的烟雾和焦油的烟，并产生多环芳烃环氧化物酶的作用下。它可以通过血液进入其他器官和组织导致基因突变，从而导致癌症，如肺癌和食管炎。