《2021年医疗保障事业发展统计快报》显示，2021年末基本医疗保险（含生育保险）累计结存36121.54亿元。结余主要集中在部分人口流入的省份和地区。
区别于大规模筛查、常态化检测，对于现行公立医疗机构新冠核酸检测的价格，国家医保局明确各省份要将单人单检降至不高于每人份16元，多人混检统一降至不高于每人份5元。
据中新经纬5月25日报道，国家医保局发函地方称，用医保基金支付大规模人群核酸检测费用不符合现行医保政策规定，要求相关地区立即整改。
一位地方医保部门的负责人介绍，一些地区虽然曾经出于“应急”有过使用医保基金进行大规模核酸检测的做法，但后来主动叫停了这种做法，改由财政负担。
从2020年开始，核酸检测领域市场迅速扩大。天眼查专业版数据显示，2021年新增医学检验相关机构437家，在快速增长的背后，却衍生出了种种乱象。5月21日，北京市房山区政府网站更新行政处罚信息显示，因原始检测数据明显少于样本检测数量，朴石医学被房山区卫健委吊销《医疗机构执业许可证》。6月6日北京市公安局房山分局以北京朴石医学检验实验室有限公司周某某、武某某等7名犯罪嫌疑人涉嫌妨害传染病防治罪，提请北京市房山区人民检察院批准逮捕。检察机关经审查，以涉嫌妨害传染病防治罪依法对周某某、武某某等7人作出批准逮捕决定。
5月27日下午，北京市公安局副局长潘绪宏通报，自今年4月25日以来，“北京金准医学检验实验室有限公司”为牟取非法经济利益，违规将多区采集的“5混1”“10混1”核酸样本，采用多管混检的方式进行检测，人为稀释样本，影响检测结果准确性，涉嫌妨害传染病防治罪。
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