甲状腺眼病的确切潜在过程并不*清楚。在Graves患者中，免疫系统产生一种称为甲状腺免疫球蛋白的异常抗体。这种抗体模拟甲状腺激素的正常功能，通常在甲状腺中产生。这些异常抗体也会影响眼睛周围的细胞，导致疾病相关的症状。研究人员认为，受影响的眼部组织含有类似甲状腺蛋白的蛋白质，抗体错误地以这些蛋白质为目标。一种称为胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)的蛋白质经常过度表达，这被认为在疾病的发展中起着重要作用。但是，并不是每个甲状腺眼病患者都有这些免疫系统异常，这表明其他异常抗体或其他因素可能会导致部分人患甲状腺眼病。研究人员仍在调查这种疾病的*。

甲状腺眼病患者可能携带甲状腺眼病基因或对甲状腺眼病有遗传易感性。遗传病患者携带一个或多个基因，但除非被某些环境因素触发或激活(多因子遗传)，否则可能无法表达。

吸烟者患甲状腺眼病的风险更高。接受放射性碘治疗(如甲亢)的个体患甲状腺眼病的风险较高。患有免疫系统功能障碍引起的其他疾病(如1型糖尿病或类风湿性关节炎)的人患甲状腺眼病的风险更高。

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