重叠综合征在中医上要进行标本兼治，其具体治疗方法如下所述。
一、以益气阴、调气血、活血化瘀通络治其本，清热解毒疏风祛湿，抗敏治其标。
1、雷公藤类制剂有活血、清热、消肿作用，对水肿性炎症性皮损、关节炎、关节痛有较好的改善作用。但该药用之不当或应用时间较长或患者已有肝肾损害，会招致患者发生药源性疾病而死亡，应引起警惕。近年来国内报道该药中毒的病例与日俱增，故应用时宜十分谨慎。
2、丹参有活血、养血、通络作用，对肢端循环障碍、皮肤软、调经等有较好改善功能。
3、活血化瘀复方中的赤芍、川芎等对皮肤硬化、关节损害有一定的治疗作用。如川芎的抑制纤维蛋白形成，丹皮的抗炎、止血，益母草的抗血栓形成，桃仁的抗变态反应，赤芍的调节神经。这些药物的作用均可能对混合性结缔组织病（MCTD）起不同的疗效。血瘀仅为MCTD表现之一，因此单一活血化瘀不能治愈MCTD，应结合病因、病机、病理生理进行中西医结合治疗，才有可能治愈。
二、合并干燥合征的中医治疗
病系阴虚体质，燥盛不已，蕴酿成毒，煎灼津液更益其燥，缓慢积累而成。病由咎之于"虚、痹、瘀"。肝肾两脏为其根蒂，治疗以滋阴润燥为基本治则，可用增液汤之类。滋阴润燥还可与其他治法配合应用。如润燥养血活血、用生血润肤饮等；润燥清营解毒用三紫汤（紫草、紫竹根、紫丹参)、犀角地黄汤加减；润燥养目用杞菊地黄类。但解毒清燥宜始终贯串，可试用土茯苓、生甘草、绿豆、磁石、紫草等。
其他生津养阴法也可合用或选用，尤其是健脾生津、酸甘化阴、醒胃生津、活血生津等法。药物如乌梅、生地、葛根、木瓜、生甘草、威灵仙、山楂、玄参等，清热生津之药如生石膏、黄芩之类。