一、X线腹平
对重度活动的患者应行X线腹部平片检查，在中毒性巨结肠患者，可发现黏膜水肿（指压痕），肠襻扩张或肠穿孔的征象，小肠CD患者可发现肠梗阻或肠襻被包块挤压移位。
二、结肠镜检查
为本病诊断与鉴别诊断的最重要手段之一，不仅可直接观察黏膜病变，病变范围，还可取活检获得组织学诊断，UC病变多从直肠开始逆行向上扩展，呈连续性，弥漫性分布，内镜下特征有：
1、黏膜弥漫性充血，水肿，血管纹理模糊，紊乱，黏膜粗糙呈细颗粒状，质脆易出血及脓血性分泌物附着。
2、病变明显处可见弥漫性多发大小及形态不一的糜烂或浅溃疡，可融合。
3、慢性病变者可见结肠袋变浅，变钝或消失，假息肉及桥状黏膜等，结肠镜下黏膜组织学检查活动期表现为弥漫性慢性及急性炎性细胞浸润，隐窝炎，隐窝脓肿，糜烂，溃疡，缓解期表现为腺体变形，排列紊乱，杯状细胞减少等黏膜萎缩改变。
4、CD病变呈节段性分布，可见鹅口疮样或纵行或匍行性溃疡，溃疡周围黏膜正常或增生呈鹅卵石样，肠腔狭窄，肠壁僵硬，可有炎性息肉，病变肠段之间黏膜外观正常，病变部位深凿活检可在黏膜固有层发现非干酪坏死性肉芽肿或淋巴细胞聚集。
三、X线造影检查
根据临床表现作钡剂小肠造影或钡剂灌肠检查，必要时结合进行，敏感性不如结肠镜，且不能进行活检，重型或暴发型UC一般不宜作钡剂灌肠检查，UC的X线特征主要有：
1、黏膜粗乱和（或）颗粒样改变。
2、肠管边缘呈毛刺样或锯齿状，肠壁见多发小龛影及充盈缺损。
3、结肠袋消失，肠管短缩，可呈铅管样。
4、CD的X线表现为多发性，节段性肠道炎症性病变，可见病变黏膜皱襞粗乱，纵行裂隙状溃疡，卵石征，狭窄，瘘管，假息肉形成等。
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