小儿埃可及柯萨奇病毒感染，目前无特效抗病毒药物，主要采取对症处理。心包炎时如诊断明确，无需穿刺放液。有颅压高时用20％甘露醇。心力衰竭用洋地黄类制剂，以快速或中速制剂为宜。
1、对症处理
本病临床治疗以对症处理为主。急性期宜加强护理、注意休息，保持适当进食和水分；吐泻者要纠正脱水、酸中毒；惊厥和严重肌痛者给予镇静止痛药；急性心肌炎伴心衰应快速洋地黄化，并及时供氧；轻瘫时注意肢体温湿敷，并予以相应理疗、针灸；对体弱者、婴幼儿危重者，支持疗法不应忽视。
2、抗病毒治疗
重症者可考虑使用干扰素、利巴韦林等核苷类抗病毒药物。免疫球蛋白中存在多种肠道病毒的中和抗体。高危儿出生后肌注入血丙种球蛋白250mg，可减少发病及减轻病情，也可用静脉用人血丙种球蛋白(IVIG)，每天400mg/kg，应用3～5天，早期可阻止肠道病毒在患儿体内复制。。