胃结核可以通过血清学、粪便潜血、胃液分析检测到致病菌，而胃镜则是主要的检查方法，具体方法如下叙述。
一、血液学检查：常有轻度贫血，血沉可增快，血清中可检查出结核抗体。
二、大便隐血检查：可呈阳性反应。
三、PPD皮肤试验：多呈阳性或强阳性反应。
四、胃液分析：常减低，也有部分病人并无胃酸缺乏。
五、胃镜活检：切片抗酸染色阳性，有干酪样肉芽肿。
六、X线钡餐检查：胃结核无特异的X线征象，可表现为龛影、充盈缺损、胃窦狭窄变形，常有十二指肠受累及幽门梗阻征象。胃黏膜粗乱，胃壁尚软，但亦有胃壁僵硬，少数甚至呈皮革胃。这些征象与胃溃疡、胃癌、胃恶性淋巴瘤和胃Crohn病等难以区别。
七、胃镜检查：诊断胃结核的主要方法。胃镜下肉眼观察胃结核病变仍不易与胃溃疡或胃癌等鉴别。但活组织检查发现下列情况则有助于结核的诊断：
1、干酪样肉芽肿。
2、切片抗酸染色或活检材料培养发现结核杆菌。
3、聚合酶链反应(PCR)检测，结核杆菌DNA呈阳性。若病变位于肌层而未破坏黏膜，胃镜检查时易误诊为平滑肌肿瘤。对黏膜下层病变，如活检时取材过浅亦可呈阴性。
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