在显微镜下，典型性的食管息肉由化学纤维血管组织组成，表层遮盖食道的鳞状上皮组织，并由此可见溃疡、糜乱或腐蚀。囊肿中的化学纤维组织成份能为松散的粘液化学纤维，也可以为高密度的纤维细胞;其中的人体脂肪组织成份有时候非常丰富，有时候则非常少。若囊肿中化学纤维组织成份较多，其病理诊断应确诊为纤维瘤;若囊肿的组成成份以人体脂肪组织主导，宜确诊为脂肪瘤。有的食管息肉被确诊为错构瘤，关键确诊根据是囊肿内有腺样成份。某些食管息肉内有显著的嗜酸性细胞侵润，因而确诊为嗜酸性肉芽肿(eosinophilic granuloma)。食道的囊肿样恶变肿瘤在临床医学上十分少见，其关键病理生理学特点是在良好囊肿的顶部能够寻找鳞肿瘤细胞。
食道息肉和食道癌的关系
食道息肉是一种良性的食道皮肤瘤，所以不要害怕，它并不是恶性的。但是也不得不注意，医榜网的经验告诉我们，小病不医，重病来袭。虽然是良性，治疗不当或不治疗也会引发息肉癌变。但值得注意的是，食道息肉可以生长在食道的任何位置且一般长度较长，在15-20厘米左右，甚至会更长。所以，有感觉到自己口腔中突然多出来一块异物的朋友，不要害怕，最好前往医院检查一下，采用合理正确的方式治疗和摘除食道息肉。
很多人意识中食道息肉就是食道癌，这种想法是极其错误的。二者有着本质区别，不可相提并论，食道息肉中属于恶性肿瘤的比率是1/50。所以低于自己的病情不要妄加揣测，不然会会对自己和家人造成恐慌。
食道息肉大多情况向生长于颈部位置，所以距离口腔极近。由于息肉生长速度较为缓慢，一旦出现了症状就已经处于病情的中晚期。生长的息肉会阻塞食道和气管，甚至可能会出现溃疡的症状。造成饮食困难和呼吸困难以及胸部前后疼痛的症状，甚至会出现窒息死亡。
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