由于十二指肠良性肿瘤是少见病，临床症状不典型，故临床上容易误诊，早期诊断有助于提高对本病的认识和警惕性，常用的诊断方法有：
1、上消化道钡剂造影
上消化道钡剂造影是十二指肠肿物首选的诊断方法，文献报道普通钡餐造影对十二指肠息肉病变诊断的阳性率64％～68％，而十二指肠低张气钡双重造影的阳性率可达93％，如果在低张造影时，加用使十二指肠松弛的药物，如高血糖素，则效果更好。
腺瘤的X线征象为肠腔内圆形充盈缺损或透亮区，边缘光滑，黏膜正常，如有蒂者则可有一定活动度，平滑肌瘤多表现为十二指肠有圆形或椭圆形缺损，边缘光滑，十二指肠的钡剂造影可以弥补纤维内镜对十二指肠第3，4段观察欠佳的不足。
2、纤维内镜
十二指肠纤维内镜可以直接观察十二指肠肿瘤情况并可以取活检或切除后活检，常用的内镜有2种，即侧视镜(side-view)和直视镜(direct-view)，由于十二指肠第3，4段观察上的局限性，故有人主张以小肠镜来检查十二指肠乳头开口以下部分的十二指肠病变较好，而上消化道造影与纤维内镜相结合可以有效地降低误诊率。
3、超声诊断
普通超声对十二指肠肿瘤诊断有一定的局限性，因十二指肠腔内的气体干扰了超声影像的观察，但如十二指肠肿瘤生长在壶腹周围，引起胆管扩张或胰管扩张；大的十二指肠球部肿物引起幽门梗阻导致胃扩张等，超声检查可能提供间接影响以供临床参考。
4、选择性动脉造影
选择性动脉造影对十二指肠肿瘤有一定诊断意义，尤其在十二指肠肿瘤的血供等方面给临床上提供重要依据，另一方面，对于内分泌肿瘤如胃泌素瘤，通过选择性动脉造影及选择性动脉注入分泌素，然后测肝静脉血胃泌素水平，以达到区域定位的目的。
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