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流行性出血性结膜炎的治疗主要是对症治疗,局部应用抗RNA病毒或广谱抗病毒药物,如干扰素、利巴韦林等可有效,如合并细菌感染,可合用抗生素滴眼液滴眼。
本病预后一般良好,不引起角膜后遗症。仅极少数病例并发瘫痪性疾患,导致长期性瘫痪与肌萎缩等后遗症。