除了相应的临床症状以外，结合以下检查结果，可以对心内膜炎进行诊断。
一、超声心动图
此已成为诊断感染性心内膜炎的主要手段之一。它能发现赘生物而使感染性心内膜炎得以确诊，此外还可提供有关瓣膜损害，血流动力学改变及复杂并发症的信息。近年来出现了经食管超声心动图，在感染性心内膜炎中价值明显优于M型超声心动图及经胸壁超声心动图。经食管超声心动图通过利用食管靠近心脏解剖位置的优势，使心脏结构更清晰显示，它是将超声心动图传感器置于内窥镜中，从食管内显示心脏结构，避免了经胸壁超声受胸壁和肺的干扰。但超声诊断也有其局限：
1、可能将瓣膜钙化、增厚、瓣叶或腱索断裂看作赘生物。
2、不易判别病灶是否为活动性感染，尤其是复发者。
3、与无菌性血栓性心内膜炎不易鉴别。
4、超声结果正常不能排除感染性心内膜炎。
二、核素检查
例如67Ga扫描可显示感染灶，近来有报道用99mTc标记的抗NCA-95抗粒细胞抗体能在感染性心内膜炎感染灶中浓聚，可作为超声心动图的辅助诊断手段，提高感染性心内膜炎的诊断率。
三、其他
直接测定特异性病原抗原及抗体，如免疫沉淀实验和补体结合试验等；心导管造影极少用于感染性心内膜炎的诊断，因有导致赘生物脱落的危险，仅偶尔用于了解瓣膜的严重程度和血流动力学变化。
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