骶髂关节结核发病缓慢，病期较长，有达15年的，多为1～2年。如无其他结核时，骶髂关节结核病人一般情况良好。在临床表现上主要有局部疼痛和脓肿，偶有跛行。有的病人会有疼痛沿坐骨神经放射。
疼痛多限于患侧臀部，盘腿穿鞋袜时较困难。早期很轻微，逐渐加重，病变突破关节囊后，脓液外溢，关节内压力减少，疼痛又减轻。到晚期，当关节发生纤维性或骨性强直时，疼痛完全消失。髂窝或臀部有脓肿者可触及波动感。骨盆挤压和分离试验常为阳性。臀部脓肿或窦道可出现臀部、髋窝或股骨大粗隆等处。
检查时在站立位脊柱前弯、后伸及侧弯均受限，并有局部疼痛，但坐位时活动较好。卧位直腿抬高试验，患侧受限并有局部疼痛。压挤或分离髂骨时患部疼痛，骶髂关节患部有压痛，可有寒性脓肿或窦道。肛指检查有时可摸到局部脓肿及压痛。X线照片检查对早期诊断很重要，需照骶髂关节正位及斜位(关节的矢状面)，可见骨质破坏、死骨及空洞形成等。