婴儿肉毒中毒综合征的临床检查手段主要有以下方面：
一、粪便检查
在婴儿型与成人的婴儿型肉毒中毒者，粪便显微镜检查可见革兰阳性芽孢杆菌。
二、细菌培养
将可疑食物，呕吐物或排泄物加热煮沸20min后，接种于血琼脂培养基作厌氧培养，可分离出肉毒梭菌。
三、毒素试验
1、动物试验：将检查标本浸出液饲喂动物，或作豚鼠，小白鼠腹腔内注射，可引起动物四肢瘫痪而迅速死亡，婴儿型者则可用婴儿粪便浸出液作动物试验。
2、中和试验：将各型抗毒素血清0.5ml注射小白鼠腹腔内，随后接种标本0.5ml同时设对照组，从而判断毒素和定型。
3、禽眼睑接种试验：将含有毒素的浸出液0.1～0.3ml，注入家禽眼内角下方眼睑皮下，出现眼睑闭合，或出现麻痹性瘫痪和呼吸困难，经数十分钟至数小时死亡，可作为快速诊断。
四、毒素检测
应用抗肉毒毒素抗体进行中和试验，检查病人血清中肉毒毒素，可对毒素分型。
五、肌电图检查
有肌纤维颤动，单次刺激反应降低，多次刺激电势反而增高，有短持续期小波幅多相运动，电势增加等表现，可作为辅助诊断。