由于小儿慢性肾功能衰竭的临床表现具有非特异性，故确诊时主要依靠化学检查。主要的检查方法有以下几种：
1、尿液检查
晚期肾功能损害明显时尿蛋白减少。尿沉渣镜检有不同程度的血尿、管型尿。粗大宽阔的蜡状管型对慢性肾衰有诊断价值。
2、血常规检查
血红蛋白降低，一般在80g/L以下，重者低于50g/L。白细胞正常或降低，感染或严重酸中毒时白细胞可升高。血小板正常或降低。红细胞沉降率增快。
3、血生化检查
检查显示血浆总蛋白<60g>1.6mmoL/L，血钾、钠、氯、阴离子的间隙随病情而变化。
4、肾功能检查
检查可见不同程度的肾功能损害。
5、其他检查
X线腹部平片，B型超声检查，放射性核素肾扫描，CT和磁共振检查等对确定肾脏的外形，大小及有无尿路梗阻、积水、结石、囊肿和肿瘤等都很有帮助。慢性肾衰晚期肾体积缩小(多囊肾，肾肿瘤除外)为其特征性改变。