真菌性鼻-鼻窦炎先单侧鼻窦起病，以上颌窦发病率最高，其次为蝶窦、筛窦，额窦罕见。
1．真菌球：鼻窦CT显示单窦不均匀密度增高，70％可见高密度钙化斑或点，可有窦壁膨隆或吸收，无骨质破坏。鼻窦CT检查是术前重要诊断参考，最终诊断依据病理。
2．变应性真菌性鼻-鼻窦炎：鼻窦CT显示病变中央高密度的变应性粘蛋白影（较均匀的毛玻璃状或极不规则的线状，有星状分布的钙化点），骨窗表现更明显。鼻窦MRI显示病变中央低信号、周边强信号。诊断主要依据：①常有特应性体质或哮喘病史，伴多发性息肉或手术史，多见于青年人；②变应原皮试或血清学检查正式为Ⅰ型变态反应；③典型鼻窦CT或MRI；④典型组织病理学；⑤Gomori染色可见病变组织中有真菌菌丝，但鼻窦粘膜和骨质中无真菌侵犯，或真菌培养结果阳性。
3．急性侵袭性真菌性鼻-鼻窦炎：依据起病急骤、病程短、进展快、免疫功能低下或缺陷病史以及临床表现，结合鼻窦CT显示累及鼻腔和多个鼻窦，广泛的骨壁破坏，侵犯面部、眼眶、颅底或翼腭窝，不难作出诊断。病变组织和鼻窦粘膜或骨质病理学证实真菌侵犯是最终诊断依据。
4．慢性侵袭性真菌性鼻-鼻窦炎：鼻窦CT表现多窦受累或骨质破坏和术中观察窦内病变为泥石样物并伴多量稠脓，窦粘膜表现为剧度肿胀、暗红色、质脆易出血和表面颗粒样改变或粘膜呈黑色、坏死样改变者，应怀疑此病。