内镜检查是诊断反流性食管炎的金标准。
1、内镜检查及活组织病理检查：内镜可以确诊反流性食管炎，并可评估其严重程度并进行分级。同时可排除上消化道器质性疾病如食管癌、胃癌等。反流性食管炎的炎症病变可分为4级：Ⅰ级为单个或几个非融合性病变表现为红斑或浅表糜烂;Ⅱ级为融合性病变，但未弥漫或环周;Ⅲ级病变弥漫环周，有糜烂但无狭窄;Ⅳ级呈慢性病变表现为溃疡、狭窄、纤维化食放宽缩短及Barrett食管。
2、食管滴酸试验：患者取坐位经鼻腔放置胃管。当管端达30～35cm时，先滴入生理盐水每分钟约10ml，历15分钟。如患者无特殊不适换用0.1N盐酸，以同样滴速滴注30分钟，在滴酸过程中出击胸骨后痛或烧灼感者为阳性反应，且多于滴酸的最初15分钟内出现。如重复二次均出现阳性反应并可由滴入生理盐水缓解者，可判断有酸胃食管反流，试验的敏感性和特异性约80％。
3、食管腔内pH测定：将一置于腔内的pH电极逐渐拉入食管内，并置于食管下端括约肌之上约5cm处。正常情况下胃内pH甚低。此时嘱患者取仰卧位并作增加腹痛部压力的动作，如闭口捂鼻、深呼气或屈腿，并用力擤鼻涕3～4次如食管内pH下降至4次下，说明有胃食管反流存在。亦可于胃腔内注入0.1N盐酸说明300ml注入盐酸前及注入15分钟后，分别嘱患者仰卧并作增加腹压动作。有胃食管反流者则注入盐酸后食管腔内pH明显下降。近年来，24小时食管pH监测已成为测定有无酸性胃食管反流的标准测定包括食管内pH<4的百分比、卧位和立位时pH<4的百分比、pH<4的次数pH<4持续5分钟以上的次数以及最长持续时间等指标。我国正常24小时食管pH监测pH<4的时间在6％以下，持续5分钟以上的次数≤3次反流最长持续时间为18分钟。这些参数能帮助确定有无酸反流，并有助于阐明胸痛及肺部疾病与酸反流的关系