1.下消化道疾病
（1）肛管疾病肛裂和痔疮。
（2）直肠疾病肛门、直肠损伤，直肠息肉，直肠肿瘤等。
（3）结肠和小肠疾病细菌性痢疾，阿米巴痢疾，局限性肠炎，肠套叠，肠结核，肠伤寒，回肠远端憩室炎，黑色素斑-胃肠息肉病，肠重复畸形，小肠血管瘤，小肠肿瘤，肠系膜动脉栓塞等。
2.上消化道疾病食管、胃和十二指肠、胆道疾病等
3.全身性及中毒性疾病
（1）出血、凝血功能障碍血液病，新生儿出血症，严重感染及DIC等。
（2）急性传染病及寄生虫病流行性出血热，伤寒、副伤寒和斑疹伤寒，钩端螺旋体病，钩虫病，血吸虫病，败血症等。
（3）中毒或药物毒性作用脓毒症，细菌性食物中毒，有毒植物中毒，药物毒性作用，化学性毒物中毒等。
（4）遗传性出血性毛细血管扩张症
以上疾病引起肠道炎症及溃疡、肠道血液循环障碍、胃肠道黏膜损伤或毛细血管通透性增高而导致便血。