病变中，卵巢可呈“巧克力囊肿”或“柏油样囊肿”，与周围组织紧密粘连。严重病人可以像慢性盆腔炎那样形成子宫内膜异位症的“冰冻骨盆”。
绝经后，除非有内源性或外源性持续的雌激素来源，否则病变逐渐退化。妊娠或激素治疗时异位内膜可呈蜕膜样变，病灶变得水肿，稍呈胶冻样，类似恶性病变。发现时应做活检明确诊断。
有时病灶表现为不典型变化，出现：①腹膜白色不透明区，可不增厚;②腹膜红色火焰样损害，常凸出腹膜表面;③腹膜表面腺体赘生物;④圆形的腹膜缺陷;⑤卵巢下粘连，卵巢下面和卵巢窝腹膜间有无色素沉着病损。这些情况常见于腹腔镜检查时，它们经活检证实为子宫内膜异位症的诊断率为45％～81％。
(2)组织学形态：镜下检查子宫内膜异位症的组织切片中可见到：①子宫内膜腺体、间质;②出血证据，即见到红细胞、吞噬大量含铁血黄素的巨噬细胞和含铁血黄素。病变周围常有大量炎性细胞、疾病水肿改变及纤维结缔组织。
镜检所见常与病灶所在部位、发病时间、受卵巢激素影响有关。异位内膜同样受卵巢激素影响，但无周期性改变。
3.恶变异位子宫内膜和正常子宫内膜的结构和功能基本相同，两者发生恶变的可能性理应一致，但异位内膜很少发生恶变。
4.分期子宫内膜异位症和某些妇科肿瘤相似，有向盆腔、腹腔内外扩散种植行为。为确定病变范围，有必要进行统一的分期法，以便据此制定合理的治疗方案，科学地进行疗效对比。
美国生育协会(AFS)根据剖腹术或腹腔镜所见制定了一个评分分期法，1985年重新修订。修订后的分期即RAFS分期已被国际广泛采用。
1989年Markham等对不包括子宫、输卵管、卵巢及周围腹膜的盆腔外子宫内膜异位症，提出了一个分类分期标准。
血常规：可用于鉴别细菌感染或是病毒感染。C反应蛋白、降钙素原(PCT)：可用于鉴别细菌或病毒感染，尤其是PCT检查目前被认为是最好的鉴别细菌和病毒感染的指标。细菌感染可见C反应蛋白、PCT升高；病毒性感染C反应蛋白大多数为正常水平。[详细]
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