四、性伴侣为治疗患者的症状持续存在，或症状消失后又复发，比较可能是性伴侣未治疗。未经治疗与性伴侣性交，病菌由未经治疗的性伴侣再次传给患者。有40%的非淋菌性尿道炎患者是没有任何症状。所以不但患者本身要治疗，其性伴侣也应接受预防性的药物治疗。

五、自身免疫力低下。同时有些患者免疫力低下，如合并有糖尿病、肿瘤、肝病、营养不良或其它慢性疾病，对尿道炎的治疗也造成很多困难。

六、并发症的影响。如若病情反复，长期性的损害，造成尿路黏膜、肾盂肾盏受损、纤维化、变形，尿路梗阻、畸形影响了正常的尿液引流和治疗，都给尿道炎的治疗带来影响，使传统药物的治疗*不佳，治疗更加困难。