急性附睾炎的病因有三种：

1、因尿道留置导管和尿道内器械检查诱发前列腺感染，及伴发急性附睾炎。

2、前列腺切除术后，由于是经尿道方式的前列腺切除术，由于射精管的开口的前列腺窝内，排尿时的尿流压力可将尿液逆流进射精管，而且前列腺切除术后8-12周内，尿液中常含有*数量的细菌。

3、无菌尿返流进输精管可导致化学性附睾炎。

急性附睾炎时附睾呈现肿胀和变硬，感染一般由附睾的下极蔓延到上极，并可出现小的脓肿，附睾旁鞘膜也分泌多量液体，精索也随之增厚，睾丸也可相应地肿胀与充血。显微镜下检查见附睾组织充血水肿，有大量白细胞、浆细胞和淋巴细胞的浸润以及脓肿形成，附睾的上皮细胞坏死。

急性附睾炎容易与精索扭转相混淆，精索扭转多半发生于青春发育期前的儿童，而急性附睾炎常见于成年男子，颇为简易的区分方法是作Prehn's征检查，将阴囊轻柔的托起到耻骨联合部位，如果疼痛症状消失，则是急性附睾炎;相反，如果阴囊托起后疼痛反而加剧，则提示精索扭转。其次，容易混淆的是睾丸损伤，但应有阴囊部位外伤史。

至于附睾结核、睾丸肿瘤等一般不会产生剧烈疼痛症状，较容易区别。