子宫腺肌病病因至今不明。目前的共识是因为子宫缺乏粘膜下层，因此子宫内膜的基底层细胞增生、侵袭到子宫肌层，并伴以周围的肌层细胞代偿性肥大增生而形成了病变。而引起内膜基底层细胞增生侵袭的因素现有四种理论：①与遗传有关；②子宫损伤，如刮宫和剖宫产均会增加子宫腺肌病的发生；③高雌激素血症和高泌乳素血症；④病毒感染；⑤生殖道梗阻，使月经时宫腔压力增大，导致子宫内膜异位到子宫的肌层。多次的妊娠以及分娩时候，子宫壁会创伤以及引起一些慢性的子宫内膜炎，而除外之外，会因为子宫内膜的基底膜下会缺乏一些粘膜的下层，而且子宫腺肌病经常还会合并一些有子宫肌瘤以及子宫内膜增生的过长，那么和一些高雌激素刺激也是有关系的。
