局部SIgA在阻止流感嗜血杆菌黏附于呼吸道黏膜中起重要作用。抗Hib荚膜多糖的杀菌抗体、抗LOS抗体及抗OMP抗体与细菌结合，其Fc段与吞噬细胞结合，对吞噬细胞的吞噬杀菌作用起调理作用。流感嗜血杆菌感染后诱生的抗荚膜杀菌抗体水平，在<2岁儿童低下，在年长儿则较高。高水平的抗LOS抗体、抗OMP抗体有助于防止Hib疾病复发。
（2）补体
Hib有激活补体经典途径与替代途径的作用。补体通过调理作用促进吞噬细胞的杀菌作用。在感染的早期以替代途径活化为主，在感染的后期则依赖于经典途径的作用。在先天性补体成分缺乏症的小儿，如C2、C3、C4或C3b灭活因子缺乏症的小儿，对流感嗜血杆菌感染的易感性增高。
（3）吞噬细胞
中性粒细胞与单核巨噬细胞共同作用，清除流感嗜血杆菌。在体内主要是由单核-巨噬细胞系统起作用。在脾切除的小儿，对流感嗜血杆菌感染的易感性增高。