1.耳膜穿孔最常见的原因：是经咽鼓管的方向引起的感染，而且多见于婴幼儿时期。由于婴儿的咽鼓管短而相对粗大，管也较直，鼻分泌物、奶汁等易经咽鼓管流入或呛入中耳而发生急性中耳炎。中耳化脓后，脓液腐蚀鼓膜，造成鼓膜穿孔。
2.耳膜穿孔直接原因：由于鼓膜菲薄所以在挖耳取出耵聍和异物时不慎损伤鼓膜,均可导致鼓膜穿孔；也多见于头部受外伤损伤鼓膜；强烈水柱或气流喷射鼓膜、误将化学腐蚀剂滴入耳内、金属屑矿渣溅入耳道、咽鼓管吹张等也可损伤鼓膜。
3.耳膜穿孔间接原因：主要是外界大气压力突然急剧变化。平时打耳光也可击伤鼓膜而穿孔；坐飞机时由于咽鼓管不通飞机降落时外耳道压力急剧变化亦可压破膜引起穿孔；如中耳腔内气压突然急剧上升，也会发生鼓膜内外气压不平衡，如用力擤鼻涕，致使中耳内气压自内向外猛烈突然冲击鼓膜，可使鼓膜穿孔。