肝腺瘤发生的真正原因未明，发病可能与性内分泌紊乱有关，婴幼儿病例可能与先天胚胎发育异常有关。Henson认为后天性因素可能与肝硬化、肝细胞结节状增生有密切关系。目前多认为口服避孕药是后天性肝腺瘤的主要原因。现认为其发生与口服避孕药有着密切的关系，在口服避孕药尚不普遍的20世纪50～60年代此病罕见，超过90％的肝腺瘤患者发生于年轻女性，且至少有75％的患者有服用避孕药史，超过30岁服用避孕药的妇女患病的危险性增高；肝腺瘤的发病率与服用避孕药的时间和剂量有直接关系；患者在停服避孕药后可见瘤体萎缩；妊娠期可见瘤体增大；绝经后妇女极少有肝腺瘤发生。发生于男性的肝腺瘤可能与糖尿病、糖原贮积症及使用雄性激素等有关。
