胆管结石伴胆管炎的成因非常复杂，有些是不可更改的因素，例如：逐渐增长的年龄、女性、种族、基因和家族史；有些是后天因素，部分是可以逆转的。
不可逆因素：
发病年龄：胆管结石伴胆管炎的发病率是随着年龄的增长而增加的。如果在儿童期发病，多与溶血或先天性胆道疾病有关。发病的高峰年龄都在40～50岁。
发病性别差异：超声诊断研究结果男女发病之比约为1∶2，女性胆管结石伴胆管炎以胆固醇结石多发，女性胆固醇结石高发可能与雌激素可以增加胆汁中胆固醇分泌、降低总胆汁酸量和活性，以及黄体酮影响胆囊收缩、致使胆汁淤滞有关。
发病与基因、家族史 胆管结石伴胆管炎发病在种族之间的差异明显，提示遗传因素是胆石病的发病机制之一。
可逆因素：
发病与妊娠的关系 妊娠可促进胆管结石伴胆管炎的形成，并且妊娠次数与胆管结石伴胆管炎的发病率呈正相关。由于孕期的雌激素增加使胆汁成分发生变化，可增加胆汁中胆固醇的饱和度；而妊娠期的胆囊排空缓慢；孕期和产后的体重变化及饮食结构也影响胆汁成分，改变了胆汁酸的肠肝循环，促进了胆固醇结晶的形成。
发病与肥胖的关系 临床和流行病学研究显示，肥胖是胆囊胆固醇结石发病的一个重要危险因素，肥胖人发病率为正常体重人群的3倍。