先天性骨与关节畸形的并发症包括疾病本身引起的并发症和术后并发症，其具体并发症状如下所述。
一、疾病本身引起的并发症
一旦形成假关节，患儿即不能负重行走，时间越久症状越严重。小腿畸形加重有时呈现“连枷状”，甚至有些病例因骨折端刺破皮肤发生感染。
二、术后并发症
1、由于本病的患儿治疗时需全麻，全身麻醉后常发生恶心、呕吐。麻醉时间越长，呕吐的发生率就越高。因此全麻病儿未清醒前去枕平卧位，头偏向一侧，可防止呕吐引起的误吸。
2、小儿对失血耐受力差，失血过多时常表现为面色苍白、伤口渗血多，此时应给予及时的对症治疗。