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本病常见的并发症是当妊娠期叶酸摄入不足胎儿可发生伴严重神经缺陷的神经管缺损。怀孕早期缺乏叶酸,还易引起胎儿神经管畸形,如脊柱裂、无脑畸形等。叶酸缺乏可引起高同型半胱氨酸血症,从而增加心血管病的危险性。