由于系统性红斑狼疮累及肺、心脏、血液等多个器官和系统，因此由系统性红斑狼疮所引发的并发症对人体危害也极大。
(1)狼疮性肾炎：几乎有85％的系统性红斑狼疮患者都会出现狼疮性肾炎这种并发症，而且它还是最难治的一种并发症，治疗不及时很容易危及患者的生命安全。
(2)狼疮性肺炎：这种并发症发生以后会导致患者咳嗽不停，严重时会出现上气不接下气的现象，严重危害患者的正常生活。
(3)血管硬化：大多数系统性红斑狼疮患者都会出现血管硬化的现象，不能够及时的治疗会引发严重的冠状动脉硬化。
(4)消化系统病变：患者常会表现为呕吐不止，食欲不振的现象。
(5)心脏瓣膜病变：假如系统性红斑狼疮患者的病情长期得不到有效的控制，很容易患上该种并发症，造成一些很严重的后果。
(6)心肌炎、心包炎：心肌炎多表现为心律不齐，而心包炎是常见的系统性红斑狼疮引起的心脏病变。
(7)另外，像日常生活中的常见的发热、口腔溃疡等都可能是系统性红斑狼疮的并发症。