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鹦鹉热衣原体肺炎的并发症近年已不多见,但如心肌炎、肝炎、脓胸、栓塞性静脉炎等仍需注意。各病变部位可发生实变、出血,严重时发生组织坏死。此外,肝、脾可肿大,局部坏死,心、肾、大血管、神经系统、消化道等均可受累。