1、肛窦炎：直肠炎不及时治疗，可并发肛窦炎等肛肠病，并有继发肛周脓肿的危险。
2、肛管炎：这是本病的一个并发症，经常与直肠炎并称为肛管直肠炎，肛管炎久拖不治亦有癌变危险。
3、肠息肉、结肠癌：直肠炎超过五年，肠道溃疡面在炎症的长期刺激下容易异常增生，引发肠息肉，一厘米以上肠息肉癌变率极高;
4、肠狭窄：多发生在病变广泛、病程持续长达5-25年以上的病例，其部位直肠，临床上一般无症状，严重时可引起肠阻塞，在本病出现肠狭窄时，要警惕肿瘤，鉴别良性恶性。
5、便血：便血是本病的主要临床表现之一，便血的多少也是衡量病情轻重的指标。长期慢性出血可引起缺铁性贫血
6、特发性溃疡性结肠炎：特发性溃疡性结肠炎原因不明，是与免疫有关的疾病，多以溃疡为主，累及结膜粘膜，以青壮年多见。腹痛常在左下腹或全腹压痛明显，伴肠鸣音亢进。有食欲减退，体重下降及营养不良等症状。可行乙状结肠镜和活组织检查以利诊断。
7、肠结核：起病缓慢，多位于右下腹部，可有阵发性绞痛，肠鸣音增强，常有大便习惯改变，干、稀交替。轻者仅有稀便，重者为粘液脓血便。可有恶心、呕吐、腹胀，食欲减退。体检仅有右下腹压痛。辅助检查：血沉增快，结肠菌试验阳性，大便培养可找到抗酸杆菌。给予纤维肠镜检查以确认急性胃肠炎。